chalkbackground

像Geek一样来记录实验

为什么实验记录本如此重要 对于“搞”科研的同学,写实验记录和报告是一个必须要养成的科研习惯。然后在国内,很多实验室都把实验记录拉低到了一个十分low的姿态,实验记录本(lab notebook)被塞进了文献总结、会议记录和草稿本云云在内的各种内容,而实验记录和报告往往只是其中的一小部分,不仅如此,其中字迹宛如天书,夹杂着大段大段的重复抄写的实验记录本也不在少数。以这样的方式做研究又有多少权威的信服力,又有能产出多少科研成果呢。归根结底在于我们对于实验记录本的不重视,不仅很

dog

ggplot2入门和进阶(下)

更多实战 例一 Michaelis-Menten动力学方程 这个例子中采用出自文献中的一组有关于浮萍氮摄取的数据,共2两个变量8个观测值,其中底物浓度与浮萍的氮取速率之间可以通过M-M动力学方程来进行描述。在这个例子中首先通过nls()根据M-M动力学方程进行模型拟合,然后用预测值进行了ggplot2绘图,主要采用了R里面的数学表示方法plotmath在图中展示了公式,并通过ggplot2种的theme对图像进行了修饰。需要注意的在geom_text()并不能直接使用expression,需要开

ggplot2_封面

ggplot2入门与进阶(上)

    ggplot2包是基于Wilkinson在《Grammar of Graphics》一书中所提出的图形语法的具体实现, 这套图形语法把绘图过程归纳为data, transformation, scale, coordinates, elements, guides, display等一系列独立的步骤, 通过将这些步骤搭配组合, 来实现个性化的统计绘图。于是, 得益于该图形语法, Hadley Wickham所开发的ggplot2是如此人性化, 不同于R基础绘图和先前的